南航特色值机服务包括自助值机、网上值机和掌上值机三种类型。自助值机，即购买南航国内航班电子客票的旅客，使用在候机楼内摆放的自助乘机设备，自己挑选位置并打印登机牌，免去了排队等待值机员办理乘机手续的烦恼。南航已经在广州、北京、沈阳、哈尔滨等15个城市开通此功能，旅客利用率也最高，2008年迄今共服务于185万人次。

　　网上值机，即登录南航主页，进入相应的页面操作并自己在家里打印登机牌，凭此打印登机牌即可乘机。除内地各大城市外，香港、吉隆坡等共31个城市都开通了网上值机功能。

　　掌上值机服务，是南航“网上值机”服务的延伸，在完成信息核对后，无需打印，点击“发送电子登机牌”，输入旅客手机号码，便会收到一条包含旅客本人登机牌信息的二维码的彩信（或短信），旅客到达机场后，经专用设备扫描二维码，系统就会自动打印出登机牌，确保旅客顺利登机。目前，南航已经在广州、北京、武汉、沈阳4个城市开通掌上值机功能。

　　南航地服系统各单位均在候机楼内设立专门的引导人员，加强宣传，采取多种手段增强旅客对特色值机服务的认识。通过南航地服人员的努力，目前已经有越来越多的旅客采用这些方便快捷的特色值机方式，自助完成乘机手续的办理。